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白色面具 复旦大学博士后和博士商议生以共同第一作家身份发表Nature Communications|染色质
发布日期:2025-03-16 00:24    点击次数:163

2024年12月30日白色面具,复旦大学人命科学学院董爱武教育团队在《当然通信》(Nature Communications)杂志在线发表了题为“The chromatin remodeling factor OsINO80 promotes H3K27me3 and H3K9me2 deposition and maintains TE silencing in rice”的商议后果。该商议施展了水稻染色质重塑因子OsINO80在常染色质促进H3K27me3修饰确立、在异染色质促进H3K9me2修饰确立并扼制转座子激活与转座的分子机制。

染色质重塑因子不错应用ATP水解开释的能量,调控组卵白与DNA之间的互相作用,动态转化染色质的结构与基因转录。INO80行动INO80染色质重塑复合物的中枢催化亚基,在DNA复制、转录及成立等基本生物学进程中施展伏击功能。在酵母、动物和植物的商议中,对于INO80是否告成调控组卵白变体H2A.Z在染色质的掺入或移除,一直存在争议;此外,INO80与异染色质的权衡,尚未被报谈。

为了恢复上述问题,商议团队应用ChIP-seq本领分析了水稻OsINO80在基因组上的分歧特征,发现OsINO80连结在三类染色质区域:类型1(T1)区域,富集常染色质相关的表不雅标志,包括H2A.Z以及H3K4me2/me3、H3K27me3、H3K36me3和 H2Aub修饰;类型2(T2)区域,富集异染色质表不雅标志H3K9me2修饰;类型3(T3)区域,隐藏表不雅标志。应用水稻OsINO80缺失突变体osino80-2,进一步分析了突变体中H2A.Z和多样组卵白修饰的变化。发现:T1区域的H2A.Z水平在osino80-2中并未发生昭彰的变化,辅导OsINO80在水稻中可能并不告成参与H2A.Z的掺入或移除进程。真谛的是,T1区域的H3K27me3修饰水平在osino80-2突变体中显耀下跌,况兼这种下跌与OsINO80在基因组的分歧位置和水平高度一致,标明OsINO80在水稻常染色质区域促进H3K27me3确立。此外T2区域的H3K9me2水平在osino80-2中显耀下跌,况兼只须抒发上调的转座子与H3K9me2水平的下跌正相关;进一步通过DNA测序,在osino80-2中断然出12个潜在的转座事件;这些放置共同辅导OsINO80在水稻异染色质区域通过促进H3K9me2实在立来保管转座子的千里默景色。

a. OsINO80在染色质上的分歧特征;b.OsINO80缺失导致T1区域H3K27me3水平下跌;c.OsINO80缺失导致T2区域H3K9me2水平下跌;d.OsINO80缺失导致转座子激活

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四川农业大学水稻商议所副教育杜康兮、复旦大学董爱武教育团队的博士后吴佳炳和博士商议生王嘉琛为本文的共同第一作家,复旦大学董爱武教育为通信作家。本商议获得了国度当然科学基金、中国博士后科学基金、国度资助博士后商议东谈主员决策和四川省科技决策项计算资助。

全文连络:

https://www.nature.com/articles/s41467-024-55387-4

着手:复旦大学人命科学学院白色面具